Der Ortsteil Kühnhausen liegt am unmittelbaren Stadtrand der Thüringischen Landeshauptstadt Erfurt. Die weitläufige Umgebung ist eben und von landwirtschaftlichen Flächen geprägt. Westlich erhebt sich die Schwellenburg, ein Naturschutzgebiet mit einer Größe von ca. 22 ha.
Durch die günstige Verkehrsanbindung über die Autobahn A 71 und die Bundesstraße B 4 gelangt man schnell und staufrei in alle Richtungen.